GenoStack Workbench

一站式生物信息学分析工作台 —— 流程管理、分析工具、任务监控与 AI 助手，装进同一个桌面窗口。

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它能做什么

做生物信息学的人大概都经历过：WDL 流程散落在各处、版本说不清；R 包环境换个机器就要重配；任务提交后成了黑盒，失败了只能翻日志。GenoStack Workbench 就是来解决这些问题的。

🖥 控制台

打开软件 3 秒看清全局：任务统计、引擎健康状态、常用流程、最近动态，一目了然。

📚 流程仓库

• 版本管理：每条 WDL 流程多版本可追溯，随时回滚
• 流程可视化：一键把 WDL 解析为节点图，依赖关系一眼看懂
• 参数表单化：input 自动生成参数表单（中文名 / 说明 / 示例 / 可选项）
• 云端仓库：流程导入、拉取、推送、发布全程可视

🔬 分析工具

把日常的 R / Python 小脚本封装为开箱即用的工具：

• 五部分自包含工具包（配置 + 文档 + 脚本 + 示例数据 + 依赖）
• 环境自动安装：首次运行自动部署 WSL + Conda 环境，依赖变了才重装
• 结果直接看：ROC 曲线、火山图、韦恩图等图片内嵌展示
• 一键导入 / 导出，整个目录拷给同事就能用

📋 任务中心

• 按状态筛选任务，步骤级详情：每步的状态、耗时、返回码逐条列出
• 任务可视化：失败步骤在节点图上直接标红，一眼定位
• 输出文件直达，图片结果在线预览

🤖 灵岸 · AI 助手

右侧常驻的智能工作流助手，用自然语言就能干活：

"我想做 RNA-seq 分析" → 推荐流程 → 逐项确认参数 → 提交运行 → 查询进度 → 拿到结果

支持找流程、看代码、跑流程、查任务、用工具画图，甚至对话式创建新的分析工具。

快速开始

1. 下载 Windows 安装包：https://console.genostack.com/Workbench/index
2. 双击安装，按向导完成 WSL 环境配置
3. 打开应用，向灵岸说你的第一个需求

💡 本仓库面向使用者。开发者文档（源码架构、本地构建、打包）见 README.dev.md。

适用人群

• 生信分析工程师：流程与脚本统一纳管，版本化、可视化、可追溯
• 课题组长：流程沉淀为团队资产，新人靠流程图 + AI 快速上手
• 实验 / 医学背景的分析需求方：描述需求 → 确认参数 → 等图出来

License

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